核心儀器設施中心新增蛋白質體定量分析服務項目

隨著人類基因體定序計畫完成,後基因體時代生命科學中最重要的研究領域之一為蛋白質體學(Proteomics)。蛋白質體學是對細胞、組織、器官或是整個生物體中全部蛋白質其功能和結構的大規模系統性的研究,愈來愈多生物醫學界的研究人員利用蛋白質體學技術探討基礎及臨床醫學的特定課題。

本院核心儀器設施中心蛋白質化學核心實驗室於2011年成立,目前使用的儀器包括:

  • 高階四極柱飛行時間串聯式質譜檢測系統(Quadrupole-time of flight tandem mass spectrometry;機型:Waters Synapt G2 HDMS與Xevo Q-TOF)
  • 三段四極桿質譜檢測系統(Triple quadrupole mass spectrometry;機型:Waters Xevo TQ)
  • 高解析四極桿串聯傅立葉轉換電場軌道質譜儀(High Resolution Hybrid Quadrupole-Orbitrap mass spectrometry;機型:Thermo Scientific QE PLUS)

提供定性與定量服務;至今協助院內同仁與院外研究人員於細胞系統醫學、癌症醫學與其他相關領域研究,成果豐碩。

Waters Synapt G2 HDMS液相層析串聯式質譜儀(LC-MS/MS)應用於蛋白質體的研究主要是蛋白質身分鑑定、蛋白質轉譯後修飾鑑定、蛋白質體定量分析、蛋白質間的交互作用和生物標誌的發現與鑑定。此次蛋白質化學核心實驗室新增的蛋白質體定量分析服務項目,是在蛋白質體樣品前處理流程之樣品酵素消化後,加入化學穩定同位素標定,以及應用多維分離技術降低樣品複雜度,且可提高蛋白質體鑑定數目,樣品再進入串聯式質譜儀進行分析,所得到的檔案再經由MASCOT Distiller軟體處理,而得到蛋白質體定量分析結果。


圖說:蛋白質體定性、定量前處理流程與LC-MS/MS分析產出之原始數據
資料來源:Advanced LC-MS applications for proteomics


圖說:原始數據處理流程
資料來源:http://www.matrixscience.com/

若對液相層析串聯式質譜儀相關服務有興趣的同仁,請洽詢本中心服務人員:沈柏村博士(電話:037-206166分機:33722)。

文/圖:核心儀器設施中心

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